Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk11bP24788 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms