Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcaP20444 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms