Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfaP20033 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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