Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms