Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RargP18911 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RargP18911 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RargP18911 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RargP18911 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms