Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps6ka1P18653 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms