Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtpraP18052 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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