Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PcnaP17918 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PcnaP17918 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PcnaP17918 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PcnaP17918 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PcnaP17918 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PcnaP17918 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PcnaP17918 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms