Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmga1P17095 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmga1P17095 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmga1P17095 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmga1P17095 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hmga1P17095 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmga1P17095 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmga1P17095 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmga1P17095 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hmga1P17095 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmga1P17095 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmga1P17095 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hmga1P17095 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hmga1P17095 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmga1P17095 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms