Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamp1P11438 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms