Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaraP11416 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaraP11416 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaraP11416 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaraP11416 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RaraP11416 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaraP11416 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RaraP11416 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaraP11416 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RaraP11416 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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