Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prf1P10820 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms