Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl2P10148 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms