Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatspereP0DP43 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms