Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms