Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spta1P08032 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spta1P08032 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spta1P08032 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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