Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TtrP07309 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TtrP07309 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TtrP07309 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TtrP07309 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TtrP07309 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TtrP07309 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TtrP07309 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TtrP07309 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TtrP07309 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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