Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Eb1P04230 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Eb1P04230 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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