Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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