Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01740 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01740 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01740 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms