Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01734 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01734 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01734 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01734 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms