Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnb1P01575 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms