Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sypl2O89104 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms