Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JtbO88824 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JtbO88824 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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JtbO88824 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JtbO88824 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms