Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp4O70480 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp4O70480 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms