Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ChkbO55229 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChkbO55229 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms