Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SlkO54988 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlkO54988 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlkO54988 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlkO54988 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlkO54988 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms