Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms