Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f6O54917 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2f6O54917 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms