Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf9O35739 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms