Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Opn1mwO35599 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms