Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cnih2O35089 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cnih2O35089 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cnih2O35089 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cnih2O35089 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cnih2O35089 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cnih2O35089 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cnih2O35089 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cnih2O35089 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cnih2O35089 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cnih2O35089 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cnih2O35089 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih2O35089 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cnih2O35089 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms