Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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