Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Casq2O09161 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq2O09161 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq2O09161 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms