Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hps1O08983 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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