Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfra2O08842 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfra2O08842 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra2O08842 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra2O08842 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms