Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eftud2O08810 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms