Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Barx2O08686 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Barx2O08686 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms