Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MttpO08601 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MttpO08601 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MttpO08601 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MttpO08601 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms