Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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