Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3542K7N6U2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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