Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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Gm21887J3QQ04 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm21887J3QQ04 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm21887J3QQ04 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm21887J3QQ04 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm21887J3QQ04 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm21887J3QQ04 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm21887J3QQ04 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm21887J3QQ04 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm21887J3QQ04 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm21887J3QQ04 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm21887J3QQ04 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 1700084J12Rik-202ENSMUST00000187707 1992 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm21887J3QQ04 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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