Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm2056J3QQ02 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms