Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer2J3QPU5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms