Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms