Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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