Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11236J3QMS7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm11236J3QMS7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm11236J3QMS7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm11236J3QMS7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm11236J3QMS7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11236J3QMS7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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