Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm3336J3QMQ6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3336J3QMQ6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3336J3QMQ6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3336J3QMQ6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms