Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

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Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo2bJ3QMK1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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