Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lipo1J3QME6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lipo1J3QME6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lipo1J3QME6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lipo1J3QME6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lipo1J3QME6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms